天赋异禀的灵宠师樊凌霄，于甲级门派晋升赛上遭人暗算，被自己的灵鲲所吞噬。睁眼醒来却发现自己已化身为一名叫“流锋芒”的少年，身处白府大牢之中，其门派凌霄阁也走到了绝境。为查明灵鲲反噬真相与重振门派，樊凌霄带着现有的几只灵宠，与谷灵、程曦、月彤，一起踏上了全新的冒险之旅。
在这个世界，万物意识皆由微观粒?构成，而岚海少年林野天生自带 “招魂” 体质，是“游魂圈”公认的 “人体快捷酒店”，整日被附身闯祸、狼狈奔逃。偶遇能收服“游魂”的异能少女陈果后，他踏入超自然组织华净学院，卷入与东瀛邪派 “九菊一派” 的百年纷争。 这期间，他连番遭受离间陷害、信任崩塌，直至界门将启，全城危亡之际，林野以凡人执念硬撼完美克隆体，拼死守住岚海。然而就在大战落幕英雄陨落之际，九菊一派的新阴谋已在昆仑深处悄然铺开……
古代搞笑版复仇者联盟，大凉都城风水奇异，每年都会有几个千年后的现代人穿越来，于是便爆发了穿越者与原住民的爱恨情仇。
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。 而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
