在《纳米核心》的里世界中，各位主角配角以及龙套们，都要在“纳米学院”中学习生活。大家在这个世界不那么认真地上课、考试、过着奇奇怪怪的校园日常，并不正经地保护着这个世界，以及不停地用各自的方式向大家“表示友好”。
一次意外的自来水厂污染，打破了屌丝青年白小飞的平淡生活。面对前所未闻超强大尸兄，小飞 毅然踏上了寻找女友的道路。但途中困难重重，身为普通人类的小飞渐渐力不从心。在注射了从网上购买的人体强化药剂后，自身潜能逐渐爆发。过五关斩六将，打败了各式各样的变异大尸兄。变异的源头幕后黑手也渐渐显露除了其锋利的獠牙……
传说，在世界顶点的十二个使徒中，祐尔曼是公认最强的存在。但同时他也是最让人类猜不透的使徒，因为没人知道他想要什么，财富？名声？势力？这些在他眼里都不值一提。而如今，这样一个传说中的使徒竟然悄悄的出现在了人类帝国的军队中。人类中隐藏的邪恶势力蠢蠢欲动，使徒力量的出现让各方势力躁动不安。
