故事设定在一个从未出现过奥特曼与怪兽的地球上。某天，一名外星人意外从宇宙坠落，他手持有着象征身份的红色宇宙回旋镖“奥美迦头镖”，并有着“究极”的称号。 失去过往记忆的外星人 “奥美迦” 化身为地球人模样，被人称为“宙人”。初到地球的宙人，对人类充满好奇，积极主动地接触和了解这些陌生的生命体。 当神秘巨型生物接连出现时，尘封的记忆碎片被唤醒，宙人认出这些生物正是记忆中的 “怪兽”。面对怪兽的威胁，强烈的使命感驱使他变身成为奥美迦奥特曼，与怪兽展开战斗。 与此同时，地球上的人类对突然现身的巨型生物，以及手持红色头镖与之战斗的巨人充满疑惑。为探寻真相，人类开始从各个角度观察这位神秘巨人。随着故事推进，来自外星的宙人与一位普通青年逐渐成为并肩作战的伙伴。作品将通过他们之间的羁绊与经历，深度探索 “奥特曼为何要守护地球” 这一问题的答案。 现在正是觉醒之时。
剧情简介：故事将从2001年起回溯到18年前。1978年巴莱奥罗格斯作战大败，次年波兰陷落。由于这两个原因，东德在1983年成为欧洲防卫的最前线，炽烈的战火开始蔓延。由于BETA集群的大规模攻势，东德部队的防线陷入了困境。东德的头号战术机甲部队，第666战术机甲中队死亡黑标受命，须以区区8骑的战力去消灭布阵在后方的光线级BETA，以逆转战局。面对数目庞大的BETA，暴雪不断的恶劣天气，以及国家权力施加在自己的头上的重压，被迫在严酷的条件下进行作战，他们的命运将走向何方？
位于东京西部的巨大的“学园都市”，这座总人口达230万的城市中，学生比例约占八成。为了开发学生的超能力，这里实施着特殊的课程体系能力，从“无能力（Level 0）”到“超能力（Level 5）”，共分为六个等级进行评定。这是一所拥有远超世间常识的科学技术，让每个人都能获得科学能力、安全生活的梦幻般教育机构——在这份和平的表象之下，存在着名为“暗部”的组织，他们专门接手那些永远无法见光的“脏活”。 “道具（Item）”是由四名少女组成的精锐部队：能够自由操控氮气，构筑铁壁防御的绢旗最爱；善用爆炸物与陷阱，将战场玩弄于股掌之间的芙兰达·塞维伦；能够读取并追踪能力者所释放的微弱力量的泷壶理后；在学园都市中仅有的七位“超能力者（Level 5）”之一的麦野沉利。出现在她们面前的第五位少女，这份相遇将“道具”引向了新的黑暗深渊…… 这是一个描绘暴力、不义与背德交织，一群相当特立独行的超能力少女们的日常、羁绊，以及那深邃无边的“黑暗”的故事。
